Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp3Q9CQ10 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms