Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc18Q9CQ07 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc18Q9CQ07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms