Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim26Q99PN3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms