Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc24a3Q99PD7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc24a3Q99PD7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms