Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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