Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms