Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms