Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms