Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms