Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms