Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cstf3Q99LI7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms