Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlgn1Q99K10 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms