Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms