Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms