Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms