Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxp3Q99JB6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxp3Q99JB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms