Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms