Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms