Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Slc8b1Q925Q3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Slc8b1Q925Q3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Slc8b1Q925Q3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Slc8b1Q925Q3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Slc8b1Q925Q3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc8b1Q925Q3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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