Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms