Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spdl1Q923A2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms