Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clip1Q922J3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms