Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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