Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin3bQ91ZU9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms