Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Pde6cQ91ZQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde6cQ91ZQ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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