Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac11Q91WA3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac11Q91WA3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms