Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox4i2Q91W29 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox4i2Q91W29 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms