Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam3cQ91VU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3cQ91VU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms