Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fyco1Q8VDC1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms