Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms