Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r200Q8R281 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Vmn1r200Q8R281 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms