Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Casc3Q8K3W3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casc3Q8K3W3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms