Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scara5Q8K299 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms