Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neil3Q8K203 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms