Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sde2Q8K1J5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms