Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem17Q8K0U3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem17Q8K0U3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms