Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkn3Q8K045 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkn3Q8K045 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms