Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm17Q8JZX4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm17Q8JZX4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm17Q8JZX4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms