Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopaQ8CIE6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms