Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms