Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm28Q8CGC6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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