Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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