Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms