Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc63Q8CDV6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms