Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E4f1Q8CCE9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms