Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Atg4aQ8C9S8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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