Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef2Q8C9J3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms