Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rfx6Q8C7R7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx6Q8C7R7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx6Q8C7R7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx6Q8C7R7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx6Q8C7R7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx6Q8C7R7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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