Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp1Q8C4U3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms