Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac7Q8C2B3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac7Q8C2B3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms